上海伊斯兰教现有7坊清真寺和1处固定处所，19名阿訇。我市16个区有相当一部分信仰伊斯兰教的回族、维吾尔族等10个少数民族常住人口为9.9437万人，经常在清真寺参加宗教活动的信教群众约1万余人。

伊斯兰教于公元七世纪初经由穆罕默德的传播而兴起于阿拉伯半岛，后发展为世界性宗教之一。唐永徽二年（651年）传入中国。亦称"清真教"、"天方教"、"回回教"，民国时期多称为"回教"。 1956年6月2日起，国内统称为"伊斯兰教"，其教徒统称"穆斯林"。    

伊斯兰教传入上海始于元代。至元十四年建立松江府，沙全任松江府达鲁花赤，元军官兵及家属遂定居松江，其中有信奉伊斯兰教的穆斯林，从而把该教带入上海。元至正年间（1341-1868年），在松江府西景家堰北，建立了上海地区第一座清真寺——松江真教寺。    

明代，有回回将领驻守金山卫和嘉定等地。明天顺年间（1457-1464年），明朝为巩固海防又将在西北地区甘州、凉州的2千多名"寄居回回"、"归属回回"迁徙到江南各卫（包括上海金山卫）。明万历元年（1573年），青浦县聚星街增建了一所"真教祠"。

    上海开埠以后，来沪谋生的穆斯林人数增多，并陆续建造了草鞋湾清真寺（俗称南寺）、穿心街清真寺（俗称北寺）、浙江路回教堂（俗称外国寺）、沪西清真寺、清真女寺、小桃园清真寺等。    

    1937年"八一三"日军侵犯上海，使上海穆斯林生命财产蒙受惨重损失，有4座清真寺（含2座女寺）毁于日军战火，数千穆斯林难民流离失所，多数伊斯兰教社团和杂志被迫解散和停刊。与此同时，也激发了上海穆斯林爱国爱教精神的发扬，和全国人民一道同仇敌忾共同抗日。十一届三中全会以后，重新落实民族宗教政策，穆斯林的宗教信仰和正当的宗教活动受到尊重和保护。1979年6月，上海市伊斯兰教协会恢复工作，在协助政府有关部门落实宗教政策，平反纠正伊斯兰教界冤假错案，恢复开放清真寺，培养年轻阿訇、恢复和开展伊斯兰文化工作，协助政府妥善处理突发事件，开展同国内外穆斯林友好交往，努力实现宗教自养等方面做了许多工作。市、区人民政府对沪西清真寺、浦东清真寺和江湾清真寺的移地重建、上海清真女寺的恢复以及对小桃园清真寺、松江清真寺的修缮等工作都予以了政策支持。